Το Μουσείο Φυσιολογίας "Γεώργιος Κοτζιάς"  συνεργάζεται με διάφορους φορείς και οργανισμούς για τον σχεδιασμό και την παρουσίαση διαδραστικών εκπαιδευτικών δραστηριοτήτων σε σχολεία Πρωτοβάθμιας και Δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης, καθώς και στο πλαίσιο επίσκεψης και ξενάγησης μαθητών και φοιτητών στους χώρους του μουσείου. 

Αποτελεί μέλος του CIVIS Museums Network, ενός νέου θεσμού που έχει αναπτυχθεί  μεταξύ των εταίρων που απαρτίζουν το Δίκτυο CIVIS και αφορά στα πανεπιστημιακά μουσεία και τις πανεπιστημιακές συλλογές.

Το Μουσείο Φυσιολογίας οργανώνει περιοδικές εκθέσεις σε συνεργασία με διάφορους φορείς και συμμετέχει σε διεθνή συνέδρια.